说到儿童的功能性便秘，首先要注意区分和器质性便秘的不同，功能性便秘并不是怎么拉都拉不出来，而是多少都存在有意无意的憋大便行为，至于为什么会憋大便，为什么会便秘，原因并不十分清楚。目前认为便秘与饮食及排便习惯关系比较密切，生活学习环境的变化也会诱发便秘。
医院小儿外科主任医师孙立泉介绍说，很多家长可能也注意到，孩子在吃母乳的时候大便都很好，但一吃配方奶就开始便秘，有时候换一种奶粉又好了。还有些孩子大便一直好好的，添加固体辅食之后就开始便秘了，原因可能就是食物中一些成份影响了排便。
我们平时喜欢用“上火”去解释一切，自然也不会放过便秘，然后开始吃一堆“去火”的“药物”，但实际可能和食物过敏，食物营养成分比例不恰当有关，比如蛋白质过多碳水化合物过少就可能导致便秘。还有调查发现便秘的孩子食物的热量普遍偏低，所以认为进食过少是便秘的一个原因，但这个结论可疑，因为便秘本身也会影响孩子的食欲，吃得少了热量也自然低了。
孙主任表示，目前比较普遍的共识是，饮食中 和水分对排便很重要。 不能被人类消化，能增加大便容量，保留水分，便大便柔软，部分 可被肠道细菌发酵分解，产生气体可刺激结肠蠕动，而水分有利于保持大便的湿润和柔软，都有利于排便。
主要来源于谷类食品、水果和蔬菜，蔬菜包括韭菜、芹菜、蒜苔、豆角、萝卜、白菜等。当然为了保持大便湿润柔软，同时也要多喝水，所以但凡便秘的孩子，医生说得最多的就是，多吃水果蔬菜，多喝水。
便秘的诊断标准按不同年龄来划分，是因为这两个年龄阶段的孩子的便秘有各自的特点。2-4岁是便秘的高发年龄，原因可能性这个年龄段的孩子正学会自主排便，正在经历排便方式的转化，还没有养成良好的排便习惯。孩子在用尿不湿的时候大便很好，学用便盆的时候，因为适应不了新的排便方式，本来就容易便秘，如果家长操之过急，过分强迫孩子，会让他对排便产生恐惧，反而加重便秘。
还有些孩子由于种种原因，比如贪玩不愿去排便，比如上课，出去玩，不方便排便，没有养成良好的习惯，排便时玩手机，看电视，坐便时吃东西或者家长抱孩子大便时看电视分散了孩子注意力，有了便意反而下意识的去憋住大便，有意收缩括约肌，让大便在直肠内潴留，时间长了直肠适应了粪便的张力，便意反而消失了。
至于精神和心理因素对便秘的影响，目前的结论并不那么明确，有报道说“铅”的增高会大大增加功能性便秘的几率。美国儿科学杂志还有篇文章明确指出28-50％的儿童功能性便秘有家族史，所以遗传因素和骶椎隐裂也可能是儿童便秘的一个重要原因。
便秘对孩子的影响，除了前面说过的精神心理方面的，还直接给孩子带来很多躯体上的痛苦，腹胀、腹痛，食欲差，甚至大便失禁，影响孩子的发育。所以不论是哪种原因引起的便秘都需要治疗。越早发现，治疗起来也相对更容易，这也是国际诊断标准的时限从原来的12周改为现在的1月和2月的原因。
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